Abstracte achtergrond
gespleten lip en gehemelte (CL /P) is een van de meest voorkomende misvormingen bij de mens. Transformerende groeifactor alfa (TGFA) is een goed gekarakteriseerde zoogdierlijke groeifactor die kunnen bijdragen aan de ontwikkeling van CL /P. Deze meta-analyse gericht op de relatie tussen de TGFA Taq I polymorfismen en CL /P te vatten.
Methods
We pakte de relevante artikelen uit PubMed, EMBASE, ISI Web of Science en SCOPUS databases. Studies werden geselecteerd met behulp van specifieke integratie en uitsluitingscriteria. De odds ratio's (OR's) en hun 95% betrouwbaarheidsintervallen (95% CI's) werden berekend aan de vereniging tussen TGFA Taq I polymorfisme en CL /P risico te beoordelen. Meta-analyses werden uitgevoerd op de totale dataset en afzonderlijk voor de grote etnische groepen, het type ziekte en de bron van controle. Alle analyses werden uitgevoerd met de Stata software.
Resultaten
Twintig artikelen zijn opgenomen in deze analyse. Er is een significant verband tussen de TGFA Taq I polymorfisme en CL /P (C1C2 vs C1C1: OR = 1,67, 95% CI = 1,23-2,25, C2C2 C1C2 + vs C1C1C1: OR = 1,52, 95% CI = 1,15-2,01; C2 vs C1: OR = 1,41, 95% CI = 1,12-1,78). Gestratificeerde analyses gesuggereerd dat de TGFA Taq I polymorfisme significant geassocieerd was met CL /P bij blanken (C1C2 vs C1C1: OR = 1,95, 95% CI = 1,34-2,86; C2C2 C1C2 + vs C1C1: OR = 1,68, 95% CI = 1,18 -2,38; C2 vs V1:. OR = 1,52, 95% CI = 1,14 -2,02)
Conclusie
TGFA Taq I polymorfisme kan worden geassocieerd met het risico op CL /P
Trefwoorden
gespleten. lip en gehemelte Clip lip Clip gehemelte transformerende groeifactor alfa Single nucleotide polymorfisme Meta-analyse Electronic aanvullend materiaal
De online versie van dit artikel (doi:. 10 1186 /1472-6831-14-88) bevat aanvullend materiaal, die beschikbaar is voor geautoriseerde gebruikers. achtergrond
Facial clefting is één van de meest voorkomende misvormingen bij de mens. Significante verschillen tussen bevolkingsgroepen in de prevalentie van schisis (CL /P) zijn gemeld, met hogere tarieven in Aziaten en Indianen dan die waargenomen bij blanken en Afrikanen. Palate formatie is complex, en er zijn tal van mogelijkheden ongewenst mogelijkheden, de meest voorkomende zijn vertraagd plank horizontalisering en onvoldoende plank groei [1].
Epidemiologische studies suggereren dat een aantal milieu-factoren zijn onderzocht als risicofactoren voor CL /P , waaronder roken van de moeder, blootstelling aan anti-epileptica, anti-emetica en vitamine gebruik tijdens de periconceptual periode maternale metabole factoren, alcoholgebruik en blootstelling aan landbouwchemicaliën [2]. Verschillende studies hebben gesuggereerd dat de moeder het roken van sigaretten verhoogd risico van het leveren van baby's met orofaciale schisis [3-6]. Eerder is aangetoond dat maternale periconceptional inname van multivitaminen met foliumzuur verminderde het optreden van CL /P [6-8]. Er is echter een studie, waarin de verschillende resultaten [9]. Een case-control studie toonde aan dat CL /P werd in verband gebracht met maternale alcoholgebruik [10]. Echter, Christensen en collega's vinden dat vóór de zwangerschap waren er minder geval moeders drinken van alcohol dan controle moeders [11]. Ondernemingen De epidemiologische kenmerken en risicofactoren van CL /P zijn niet duidelijk. Er is ook een sterke genetische component schisis. De gastheer susceptibiliteitsfactoren kan een belangrijke rol spelen bij de ontwikkeling van CL /P. Ardinger en collega's voerde de eerste studie om een case-control design gebruiken om kandidaat-genen [12] te testen. Ze vonden een significant statistisch verband tussen CL /P en twee van 12 markers in vijf genen, met een intronic Taq1
marker in het transformerende groeifactor alfa (TGFA) gen met de sterkste vereniging. TGFA gecodeerd door een gen dat in kaart gebracht op 2p13, een secretie-eiwit dat bindt aan de epidermale groeifactorreceptor (EGFR) en is gelegen op de tong epitheel tijdens gehemelte sluiten [13]. TGFA kan functioneren als een normale embryonale versie van EGF-verwante groeifactor [14]. EGF /TGFA en glucocorticoïden worden verondersteld om de proliferatie en differentiatie van epitheelcellen palatale reguleren zowel in vitro als in vivo
. Bovendien is de voortdurende aanwezigheid van EGF remt het fusieproces; TGFA waarschijnlijk vergelijkbare effecten hebben. Deze biologische studies suggereren dat mutaties in het gen TGFA kan bijdragen tot de ontwikkeling van CL /P, vooral voor die mutaties die de timing van de weefselspecifieke expressie van dit gen beïnvloeden. Ondernemingen De TGFA gen toont een restrictiefragmentlengtepolymorfisme bij behandeling met Taq I restrictie-enzym. Het mutante allel toont een vier-base (TAAT) schrappen. In dit geval wordt een 178 basenparen (bp) C1 allel en een 174-bp C2 allel [15]. TGFA Taq polymorfisme zich op intron 5 en is 602 bp in de 59 richting van de acceptor plaats van exon 6 [16]. Voor deze polymorfisme, C1C1 is wild genotype, C1C2 is heterozygoot genotype en C2C2 is homozygote mutatie genotype. In de meeste studies, zijn er verschillende vormen van vergelijkingen zoals heterozygote vergelijking (C1C2 vs. C1C1), homozygote vergelijking (C2C2 vs C1C1), dominant model (C1C2 C2C2 + vs C1C1), recessief model (C2C2 C1C2 vs + C1C1) en allelische model (C2 vs C1). Ardinger en collega's voor het eerst gemeld associatie tussen de Taq I polymorfismen bij de TGFA locus en CL /P gevoeligheid in een case-control studie [12]. Deze bevinding is sindsdien gerepliceerd in sommige studies [6, 15, 17-23]. Er zijn echter nog steeds controverses van het effect van TGFA polymorfisme op de aanleg van deze misvorming [24-35]. Ondernemingen De bovenstaande inconsistent conclusies in de bevindingen van de studie kan worden toegeschreven aan de grootte van de monsters, de etnische van het monster bevolking en andere redenen. Om bij te dragen tot een beter begrip van de rol van dit gen bij het ontstaan van gespleten lip, een gespleten lip of schisis, een geactualiseerde meta-analyse van alle beschikbare case-control studies uit te voeren we, data samen te combineren te bereiken een grotere steekproef, om meer statistische power om de associatie tussen CL /P gevoeligheid en TGFA Taq I polymorfisme evalueren krijgen. Inzicht in de genetische achtergrond en de etiologie van CL /P is van essentieel belang voor zowel de risico-evaluatie en de bevindingen van de effectieve methoden voor preventie en behandeling.
Methoden
Gegevensbronnen
We pakte de artikelen met behulp van de volgende termen "Transforming growth factor-alfa of TGFA "en" gespleten lip of gespleten gehemelte of schisis "van PubMed, Embase, ISI Web of Science en SCOPUS (Laatste zoekopdracht is bijgewerkt op oktober 2013). Er was geen een taal beperking en de leeftijd van de deelnemers werd niet beschouwd als selectiecriteria. We evalueerden potentieel relevante publicaties door het onderzoeken van hun titels en abstracts en alle studies die overeenkomen met de in aanmerking komende criteria werden teruggevonden
Studie selectie en data-extractie
aanmerking komende studies werden geselecteerd op basis van de volgende criteria expliciet op te nemen:. (A) evaluatie van de TGFA Taq I polymorfisme en CL /P risico's, (b) met behulp van de methodologie van een case-control studie om de homogeniteit tussen de opgenomen studies in de meta-analyse te houden.
dupliceren en uiteraard niet verwante artikels werden geëlimineerd door één auteur ( CF). Samenvattingen van de overige artikelen waren onafhankelijk van elkaar onderzocht door twee auteurs (C.F. en E.Z.) om te bepalen of de full-text artikel moet worden gezocht. Als er meningsverschillen tussen CF en EZ waren bij het selecteren van documenten, zou de derde auteur (L.L.) de artikelen te beoordelen en de uiteindelijke beslissing met CF en EZ. Een vier fasen stroomdiagram volgens Systematic Reviews (http:.. //Www prisma-statement org /) werd weergegeven in figuur 1. We hebben de Newcastle-Ottawa Scale (NOS) gebruikt, voorgesteld door Cochrane Collaboration , om de kwaliteit van elke opgenomen onderzoek in deze meta-analyse. De volgende informatie werd verkregen uit elke publicatie: naam van de eerste auteur, jaar van uitgave, land herkomst, etniciteit, case kenmerken, het totale aantal gevallen en controles, nummers van elke groep met TGFA Taq I genotypes, respectievelijk. Figuur 1 Stroomschema van het onderzoek selectieproces.
statistische methoden Ondernemingen De odds ratio's (OR's) en hun 95% betrouwbaarheidsintervallen (95% CI's) werden berekend aan de vereniging tussen TGFA Taq I polymorfisme en CL /P beoordelen. Gepoolde OR's werden uit combinatie van enkele studie verkregen door heterozygote vergelijking (C1C2 vs. C1C1), homozygote vergelijking (C2C2 vs C1C1), dominant model (C1C2 C2C2 + vs C1C1), recessief model (C2C2 C1C2 vs + C1C1) en allelische model ( C2 vs C1), respectievelijk. Deze vergelijkingen werden gebruikt om meer informatie over de relatie tussen het polymorfisme en de ziekte te verstrekken, de vereniging in ander gezichtspunt evalueren en valideren van de vereniging door vele manieren, evenals bieden de gegevens voor verder onderzoek op de genexpressie. Meta-analyses werden uitgevoerd op de totale dataset en afzonderlijk voor de bron van de controle en het type ziekte. We onderzochten de tussen-studie heterogeniteit door Q-test van de Cochran en gekwantificeerd door I2. Om overzichtsstatistieken krijgen voor ultraperifere regio's van het polymorfisme en de ziekte, we uitgevoerd eerste analyses met een fixed-effect model en bevestigende analyses met een random-effect model als er significante heterogeniteit. Als er geen heterogeniteit, de vaste en random effectmodellen vergelijkbare resultaten opleveren, en zo niet, het random-effect model geeft meestal breder CI dan de vaste-effect model. Als de P-waarde is & gt; 0,05 van de Q-test, de samenvatting of raming van elk onderzoek werd berekend door de vaste-effect model. Anders was het random-effect model gebruikt.
Wij getoetst mogelijke publicatie vertekening door het onderzoeken van trechter percelen en het gebruik van testen Egger's [36, 37]. Een trechter plot is een grafiek is ontworpen om te controleren op de aanwezigheid van publicatie bias in systematische reviews en meta-analyses. Aangezien publicatie bias, wordt ervan uitgegaan dat de grootste studies wordt geplot bij de gemiddelde en kleine studies wordt gelijkmatig verdeeld aan weerszijden van het gemiddelde, waardoor een ongeveer trechtervormig distributie. Afwijking van deze vorm kan publicatie vertekening aan te geven. Deze benadering is zeer eenvoudig te gebruiken, maar soms kan getwijfeld de trechter asymmetrie, vooral als het aantal studies is gering. Bovendien kan de trechter asymmetrisch als gevolg van een gebrekkige kwaliteit van studies of omdat het hier gaat om maatregelen waarvan het effect hangt af van het monster van elk onderzoek. Voor deze situaties, kunnen lineaire regressie Egger's worden gebruikt. -test Egger's plots de regressielijn tussen de precisie van de studies (onafhankelijke variabele) en de gestandaardiseerde effect (afhankelijke variabele). Als er niet publicatiebias de regressielijn zijn oorsprong in de Y-as nul. Zo veel verder weg van nul, verder bewijs van publicatie vooringenomenheid. De betekenis van het snijpunt bepaald door de t-test
zoals door testen Egger. Alle P-waarden zijn tweezijdig en alle analyses werden uitgevoerd met de Stata softwareversie 11,0 (Stata Corp., College Station, TX).
Resultaten
Gedetailleerde kenmerken van elk onderzoek zijn samengevat in tabel 1. In totaal 20 case-control studies, waaronder 3824 gevallen en 7710 controles hebben bijgedragen aan de analyse. De onderwerpen die in de studie waren populatie van Kaukasische, Afrikaanse, Latijns-Amerikaanse en Aziatische. Er zijn een aantal studies, waaronder meer dan een etnische bevolking. Er waren 14 studies die de Europeanen, 4 studies met inbegrip van Hispanics, 3 studies waarbij Afrikanen en 2 studies bestaande uit Aziaten. Voor de Europeanen, Hispanics, Afrikanen en Aziaten, steekproefomvang varieerde 25-1525, 90-921, 17-69 en 12 tot 100, respectievelijk. De totale omvang steekproef werden 2897 gevallen en 6806 controles voor de Europeanen, 853 gevallen en 753 controles voor de Iberiërs, 41 gevallen en 72 controles voor de Afrikanen en 33 gevallen en 79 controles voor de Aziaten. De aard van de controles opgenomen basis van de bevolking, ziekenhuis-based en niet-verbonden familie members.Table 1 Kenmerken van de studies opgenomen in de meta-analyse
Auteur, jaar
Land
Afkomst
Clip soort
Regelkarakteristiek
No. (Case /control)
Case
Controle
C1C1
C1C2
C2C2
C1/C2
C1C1
C1C2
C2C2
C1/C2
BEATY [31]
USA
Caucasian
CP
HB
42/135
-
-
-
78/6
-
-
-
248/22
Caucasian
CL/P
HB
86/135
-
-
-
163/9
-
-
-
248/22
African
CP
HB
13/135
-
-
-
24/2
-
-
-
248/22
African
CL/P
HB
11/135
-
-
-
22/0
-
-
-
248/22
TANABE [15]
Japan
Asian
CL/P
HB
28/73
-
-
-
49/7
-
-
-
129/17
Lilian Jara[21]
Chile
Hispanic
CL/P
HB
39/51
33
6
0
72/6
44
6
1
94/8
Sassani [19]
USA
Caucasian
CL/P
HB
81/84
54
26
1
134/28
70
13
1
153/15
Asian
CL/P
HB
6/6
4
2
0
10/2
4
2
0
10/2
African
CL/P
HB
10/7
4
5
1
13/7
4
3
0
11/3
Ardinger [12]
USA
Caucasian
CL/P
HB
78/98
59
17
2
135/21
89
8
1
186/10
Shiang [20]
USA
Caucasian
CP
HB
43/170
-
-
-
69/17
-
-
-
311/29
Hwang [22]
USA
Caucasian
CP
HB
69/284
49
20
0
118/20
239
44
1
522/46
Caucasian
CL/P
HB
114/284
93
19
2
205/23
239
44
1
522/46
ROMITTI [30]
USA
Caucasian
CP
PB
51/295
41
10*
-
-
235
60*
-
-
Caucasian
CL/P
PB
118/295
96
22*
-
-
235
60*
-
-
Hecht [24]
USA
Caucasian
CL/P
UFM
12/13
11
1
0
23/1
10
2
1
22/4
Chenevix [18]
Australia
Caucasian
CL/P
HB
117/113
84
30
3
198/36
94
17
2
205/21
Holder [17]
UK
Caucasian
CL/P
HB
60/60
36
14
5
86/24
55
5
0
115/5
CHENEVIX[29]
Australia
Caucasian
CL/P
HB
96/100
66
27
3
159/33
90
9
1
189/11
Stoll [25]
France
Caucasian
CL/P
HB
98/99
-
-
-
187/10
-
-
-
184/14
Caucasian
CP
HB
57/99
-
-
-
104/10
-
-
-
184/14
Christensen [11]
Denmark
Caucasian
CP
PB
65/457
49
15
1
113/17
344
102
11
790/124
Caucasian
CL/P
PB
191/457
145
45
1
335/47
344
102
11
790/124
SHAW [6]
USA
Caucasian
CP
PB
114/379
87
27*
-
-
321
58*
-
-
Hispanic
CP
PB
35/175
34
1*
-
-
164
11*
-
-
African
CP
PB
7/20
6
1*
-
-
18
2*
-
-
Caucasian
CL/P
PB
245/379
212
33*
-
-
321
58*
-
-
Hispanic
CL/P
PB
103/175
94
9*
-
-
164
11*
-
-
African
CL/P
PB
12/20
11
1*
-
-
18
2*
-
-
Beaty [26]
USA
Caucasian
CP
HB
51/87
44
6
1
94/8
79
8
0
166/8
Caucasian
CL
HB
26/87
21
5
0
47/5
79
8
0
166/8
Caucasian
CL/P
HB
53/87
48
5
0
101/5
79
8
0
166/8
African
CP
HB
12/45
10
2
0
22/2
43
2
0
88/2
African
CL
HB
2/45
2
0
0
4/0
43
2
0
88/2
African
CL/P
HB
10/45
9
1
0
19/1
43
2
0
88/2
Bertoja [34]
Brazil
Hispanic
CL/P
HB
140/142
114
25
1
253/27
121
21
0
263/21
PASSOS-BUENO [32]
Brazil
Hispanic
CL/P
HB
536/385
484
51
1
1019/53
344
41
0
729/41
Lidral [28]
USA
Caucasian
CL/P
PB
182/251
-
-
-
327/37
-
-
-
449/53
Caucasian
CP
PB
62/251
-
-
-
109/15
-
-
-
449/53
Lidral [27]
USA
Caucasian
CL/P
PB
652/776
-
-
-
1204/100
-
-
-
1436/116
Caucasian
CP
PB
97/776
-
-
-
176/18
-
-
-
1436/116
CL extra's: klem lip, CL /P bestellen: clip lip en gehemelte, CP extra's: clip gehemelte, PB Twitter: populatie-gebaseerde controle groep, HB extra's: ziekenhuis-gebaseerde controle groep, UFM extra's: niet-verwante familieleden controlegroep
C1C1, C1C2, C2C2:. genotype, C1 /C2:.. allel frequentie
* de som van C1C2 en C2C2
NOS resultaten suggereerden dat alle opgenomen studies zijn hoge kwaliteit met de score & gt;. 6
vereniging tussen de genotypen van TGFA Taq1 en CL /P risico
Een samenvatting van de bevindingen van meta-analyse van de associatie tussen TGFA Taq I en CL /P risico wordt gegeven in Tabel 2. Meta-analyse toonde een statistisch significant verband tussen TGFA Taq I polymorfisme en CL /P risico heterozygote vergelijking, dominant en allele model (C1C2 vs C1C1: OR = 1,67, 95% CI = 1,23-2,25, P = 0,009 voor heterogeniteit, I
2 = 55,8%; C2C2 + C1C2 vs C1C1: OR = 1,52, 95% CI = 1,15-2,01, P & lt; 0,001 voor heterogeniteit, I 2 = 64,7%; C2 vs C1 : OR = 1,41, 95% CI = 1,12-1,78, P & lt; 0,001 voor heterogeniteit, I 2 = 65,2%), maar niet in de homozygote en recessieve model (C2C2 vs C1C1: OR = 1,57, 95% CI = 0,87-2,83, P = 0,525 voor heterogeniteit, I 2 = 0,0%; C2C2 C1C2 vs + C1C1: OR = 1,43, 95% CI = 0,79-2,59, P = 0,634 voor heterogeniteit, I 2 = 0,0%). Meta-analyse resultaten van de associatie tussen TGFA Taq I polymorfisme en CL /P risico onder de heterozygote vergelijking model (C1C2 versus C1C1), het dominante model (C1C2 + C2C2 versus C1C1), en de allelische model (C2 versus C1) waren ook weergegeven in figuur 2, figuur 3 en figuur 4, respectively.Table 2 associatie tussen TGFA Taq1 polymorfisme en CL /P risico
Model
aantal studies
Vaste effect
Random effect
Phet
I-squared (%)
C1C2 vs. C1C1
12
1,46 [1.22,1.75]
1,67 [1.23,2.25]
0.009
55,8
C2C2 vs. C1C1
12
1.57 [0.87,2.83]
1.56 [0.78,3.16]
0,525
0.0
C1C2 + C2C2 vs. C1C1
14
1,33 [1.14,1.54]
1.52 [1.15,2.01]
0.000
64,7
C2C2 vs. C1C2 + C1C1
12
1.43 [0.79,2.59]
1.42 [0.70,2.85]
0,634
0.0
C2 vs. C1
18
1.26 [1.12,1.43]
1,41 [1.12 , 1.78]
0.000
65,2
Figuur 2 Forest plot van het risico op kanker in verband met TGFA Taq I polymorfisme onder de heterozygote vergelijking model (C1C2 versus C1C1).
Figuur 3 Forest plot van het risico op kanker in verband met TGFA Taq I polymorfisme in het kader van het dominante model (C1C2 + C2C2 versus C1C1).
Figuur 4 Forest plot van het risico op kanker in verband met TGFA Taq I polymorfisme onder de allele model (C2 versus C1).
Gestratificeerde meta-analyse
Gestratificeerde analyses werden uitgevoerd door etniciteit, de bron van de controle en het type ziekte. Samengevoegd ultraperifere regio's en 95% CI van gestratificeerde meta-analyse worden getoond in Tabel 3. In de subgroep analyse naar etniciteit, aanzienlijk toegenomen CL /P's werden gevonden onder de blanke (C1C2 vs C1C1: OR = 1,95, 95% CI = 1,34-2,86 ; C2C2 C1C2 + vs C1C1: OR = 1,68, 95% CI = 1,18-2,38; C2 vs C1: OR = 1,52, 95% CI = 1,14-2,02). Geen significant geëvalueerd risico werd gevonden tussen Afrikaanse en Latijns-Amerikaanse bevolking in een van de genetische models.Table 3 Pooled ultraperifere regio's en 95% CI van gestratificeerde meta-analyse van Zazzle.nl Subgroep
Genotype-verhuur No van studies
Test van vereniging
Test van heterogeniteit
OR (95% CI)
Z
P-waarde
Model
P-waarde
I2 (%)
Afkomst
Afrikaanse
C1C2 + C2C2 vs. C1C1
3
1,92 [0.63,1.90]
1,14
0,253
F
0,754
0.0
C2 vs. C1
3
1.15 [0.50,2.66]
0.33
0.741
F
0.254
26.9
Caucasian
C1C2 vs. C1C1
9
1.95 [1.34,2.86] *
3,48
0.001
R
0,016
57,3
C2C2 vs. C1C1
9
1.50 [0.79,2.84]
1,25
0,211
F
0,341
11.2
C1C2 + C2C2 C1C1 vs.
9
1.68 [1.18,2.38] *
2.87
0.004
R
0.000
69,9
C2C2 vs. C1C2 + C1C1
9
1.36 [0.71,2.58]
0,93
0,354
F
0,443
0.0
C2 vs. C1
14
1,52 [1.14,2.02]*
2.87
0.004
R
0.000
74.8
Hispanic
C1C2 vs. C1C1
3
1,02 [0.72,1.43]
0.08
0,935
F
0,594
0.0
C2C2 vs. C1C1
3
1,44 [0.27,7.67]
0.42
0,672
F
0,669
0.0
C1C2 + C2C2 C1C1 vs.
verhuur 4
1,04 [0.76,1.44]
0,27
0,789
F
0,792
0.0
C2C2 vs. C1C2 + C1C1
3
1,40 [0.26,7.46]
0.4
0,692
F
0,663
0.0
C2 vs. C1
3
1.04 [0.75,1.44]
0.23
0,816
F
0,608
0.0
Disease
CP
C1C2 vs. C1C1
3
1.54 [1.04,2.27] *
2.14
0,032
F
0,215
34,9
C2C2 vs . C1C1
3
1.32 [0.35,5.00]
0.40
0,687
F
0,478
0.0
C1C2 + C2C2 vs. C1C1
5
1.45 [1.10,1.91]
2,61
0,009
F
0,281
21,0
C2C2 vs. C1C2 + C1C1
3
1.26 [0.33,4.78]
0,33
0,738
F
0,496
0.0
C2 vs. C1
8
1,38 [1.10,1.73] *
2,82
0.005
F
0,226
25,4
CL /P
C1C2 C1C1 vs.
12
1.60 [1.16,2.20] *
2,89
0.004
R
0.010
55,7
C2C2 vs. C1C1
11
1,64 [0.88,3.04]
1.57
0,116
F
0,457
0.0
C1C2 + C2C2 vs. C1C1
11
1.46 [1.09,1.95] *
2.55
0,011
R
0.001
62,7
C2C2 vs. C1C2 + C1C1
11
1.45 [0.82,2.78]
1,25
0,211
F
0,545
0.0
C2 vs. C1
17
1.29 [ ,,,0],1.01,1.66] *
2,03
0,042
R
0.000
63,1
Source of control
HB
C1C2 vs. C1C1
10
1.84 [1.32,2.56] *
3.58
0.000
R
0.019
54,7
C2C2 C1C1 vs.
10
2.96 [1.35,2.70] *
4.70
0.000
F
0,965
0.0
C1C2 + C2C2 vs. C1C1
10
1.99 [1.35,2.70] *
3,66
0.000
R
0.007
60,1
C2C2 vs. C1C2 + C1C1
10
2.38 [1.06,5.55] *
5.17
0.000
F
0,968
0.0
C2 vs. C1
14
1.63 [1.22,2.18] *
3,28
0.001
R
0.001
63,0
PB
C1C2 + C2C2 C1C1 vs.
3
0.99 [0.79,1.24]
0,10
0,917
F
0,549
0.0
C2 vs. C1
3
1.00 [0.83,1.20]
0.02
0,986
F
0,778
0.0
* OR had statistische significantie met bijbehorende 95% CI niet inbegrepen 1. F: Fixed effect model; R:. Random effect model
In de subgroep analyse afhankelijk van het type ziekte, de ultraperifere regio's van de heterozygote vergelijking, dominant en allelische model met CL /P zijn statistisch significant (C1C2 vs C1C1: OR = 1,60, 95% CI = 1,16 -2,20; C2C2 C1C2 + vs C1C1: OR = 1,46, 95% CI = 1,09-1,95; C2 vs C1: OR = 1,29, 95% CI = 1,01-1,66). Voor de CP, werden de significante resultaten waargenomen in heterozygote vergelijking, dominant en allele model (C1C2 vs C1C1: OR = 1,54, 95% CI = 1,04-2,27; C2C2 C1C2 + vs C1C1: OR = 1,45, 95% CI = 1.10- 1,19; C2 vs C1: OR = 1,38, 95% CI = 1,10-1,73)
In de subgroep analyse door controle kenmerken, de ultraperifere regio's van de heterozygote vergelijking homozygote, dominant, recessief en allelische model voor de ziekenhuis-based. controle zijn statistisch significant (C1C2 vs C1C1: OR = 1,84, 95% CI = 1,32-2,56; C2C2 vs C1C1: OR = 2,96, 95% CI = 1,35-2,70; C2C2 C1C2 + vs C1C1: OR = 1,99, 95% CI = 1,35-2,70; C2C2 C1C2 vs + C1C1: OR = 2,38, 95% CI = 1,06-5,55; C2 vs C1: OR = 1,63, 95% CI = 1,22-2,18). Hoewel geen statistisch significant verband werd gevonden bij controles populatiegebaseerde.
Heterogeniteit tussen onderzoeken werd waargenomen in algemene vergelijkingen en ook subgroepanalyses. Zo werden meta-analyses uitgevoerd middels random-effect model (Tabel 2). Belgique Om potentiële heterogeniteit van deze meta-analyse verkennen, werden meta-regressieanalyses uitgevoerd. De covariaten opgenomen etniciteit en de bron van controle. In alle heterozygote vergelijking homozygote, dominant, recessief en allelische modellen vooral potentiële factoren zijn waarschijnlijk niet de belangrijkste bronnen van heterogeniteit (P-waarden waren & gt; 0,05 of nabij 0,05). De heterogeniteit wellicht toe te schrijven aan andere factoren, de onvoldoende gegevens beperkt tot hun bronnen alleen met behulp van meta-regression.No publicatie vooringenomenheid identificeren werd gedetecteerd door ofwel de omgekeerde trechter plot of de proef Egger's. De vorm van de trechter plots leek ongeveer symmetrische en P-waarden van de test Egger 'waren niet statistisch significant (P-waarden waren & gt; 0,05). Figuur 5 en figuur 6 toonde de trechter plot onder de heterozygote vergelijking model (C1C2 versus C1C1) en de allelische model (C2 versus C1). Figuur 5 Trechter plot onder de heterozygote vergelijking model (C1C2 versus C1C1).
Figuur 6 Funnel plot onder de allele model (C2 versus C1).
Discussie Ondernemingen De individuele gevoeligheid een belangrijke rol bij de ontwikkeling van de meeste ziekten speelt. Daarom is de studie van de genetische gevoeligheid zijn nuttig voor de ziekte van preventie, diagnose en behandeling.
TGFA is een goed gekarakteriseerd zoogdieren groeifactor. Uit eerdere studies bleek dat, hoewel TGFA wordt uitgedrukt in muizen tijdens palatogenesis en muizen met een nul-mutatie van het gen TGFA abnormale huid, haar en ogen, maar ze hebben niet CL /P [38, 39]. TGFA een waarschijnlijke ligand voor epidermale groeifactor receptor en pasgeboren epidermale groeifactor receptor-negatieve /-negatieve muizen hoge incidentie van CL /P waarin het verband tussen TGFA polymorfismen en CL /P [40] kan verklaren. In 1989 werd eerst gepubliceerd dat de TGFA Taq polymorfisme bijgedragen aan de ontwikkeling CL /P in de mens. Vanaf dat moment, hebben een groeiend aantal studies gedaan naar de relatie tussen TGFA Taq I polymorfisme en de risico's van de CL /P te onderzoeken. Echter, de resultaten zijn niet consistent. Met het oog op een beter begrip van de vereniging onderworpen we eerder gepubliceerde gegevens aan meta-analyse om genetische associaties tussen de TGFA Taq I polymorfisme en CL /P gevoeligheid te evalueren.
Door deze meta-analyse vonden we dat TGFA Taq I polymorfisme verhoogde de risico op CL /P. Mitchell nam een herwaardering en toonde aan dat er een statistisch significant verband tussen TGFA en CL /P, echter, was er tekenen van significante heterogeniteit van verschillende studies met betrekking tot een associatie tussen genetische variatie in het TGFA locus en CL /P blijft onduidelijk [41 ]. Een meta-analyse van gen-omgeving interactie toonde de suggestieve bewijs voor gen-omgeving interactie tussen genotype van het kind in het Taq1 marker in TGFA en roken van de moeder was beperkt tot CP [42]. Meta-review van schildklierkanker profilering van genexpressie studies identificeert belangrijke diagnostische biomarkers, met inbegrip van relatief roman of gekarakteriseerde genen zoals TGFA [43]. Deze resultaten van systematische reviews in zekere mate ondersteunen de bevindingen in de huidige meta-analyse.
Om heterogeniteit te verminderen, voerden we de gestratificeerde analyses. Het is bekend dat het voorkomen van de genetische polymorfismen kunnen variëren tussen de verschillende etnische populaties en het brede spectrum TGFA Taq I allel frequenties in verschillende studies suggereert de heterogeniteit tussen populaties kunnen voorkomen [28]. In de subgroep analyse naar etniciteit, vonden we dat TGFA Taq I polymorfisme verhoogde het risico op CL /P in blanke bevolking, die met Ardinger en collega's [12], Shiang en collega's [20], Hwang en zijn collega's [22], Chenevix overeengekomen -Trench en collega's [18], Holder en collega's [17], en het niet eens met Lidral en collega's [27], [28], Stoll en collega's [25] en Christensen en collega's [11]. In de subgroep analyse van het type ziekte, vonden we de ultraperifere regio's van verschillende soort ziekte waren statistisch significant, welk type ziekte gesuggereerd werd niet hoofdzakelijk het gevolg van de heterogeniteit. In de subgroep analyses regeleigenschappen alleen de UPR van ziekenhuis op basis controlegroepen waren statistisch significant. Daarom subgroepanalysen gesuggereerd dat etniciteit en regeleigenschappen kan bijdragen tot de heterogeniteit in de meta-analyse. De meta-regressie analyses gesuggereerd dat etniciteit of controle kenmerken waren waarschijnlijk niet de belangrijkste bronnen van heterogeniteit. De heterogeniteit kunnen toeschrijven aan andere factoren. De onvoldoende gegevens zijn beperkt tot de bron van heterogeniteit alleen met behulp van meta-regressie te identificeren.
Ondanks proberen ons best om een uitgebreide meta-analyse uit te voeren, een aantal beperkingen bestaan in onze studie. Hoewel de resultaten voor publicatie bias in onze studie waren niet statistisch significant, gebruikt onze analyse gepubliceerde internationale studies, welke publicatie vertekening kan ontstaan. Gebrek aan de oorspronkelijke gegevens van beschikbare studies beperkt onze verdere evaluatie van mogelijke interacties, zoals leeftijd, geslacht, familiegeschiedenis, milieufactoren en levensstijl. Er waren geen significante resultaten in gestratificeerde analyses tussen de Afrikaanse en Latijns-Amerikaanse bevolking, omdat er te weinig studies na stratificatie. Daarom zijn meer studies nodig om meer bewijs te leveren over de associatie tussen TGFA polymorfisme en CL /P in verschillende etnische bevolkingsgroepen.
Hoewel CL /P is een complexe ziekte, onze studie het bewijs geleverd waaruit de belangrijke rol van TGFA genen polymorfismen in de ontwikkeling van CL /P kunnen genetische factoren ziektegevoeligheid en ernst gepersonaliseerde geneeskunde vergemakkelijken. Verder begrip van de interacties tussen genetische reguleringsmechanismen essentieel is voor het ontdekken van nieuwe therapieën voor het beheer van menselijk CL /P. Hierbij zou het doelgerichte therapie de polymorfismen van verwante genen een veelbelovende mogelijkheid voor toekomstige CL /P diagnose en behandeling.
Samenvattend meta-analyse ondersteunt de TGFA Taq I polymorfisme zal eerder bijdragen tot de vatbaarheid van CL /P, vooral in de subgroep van de blanke bevolking.
Conclusie
TGFA Taq I polymorfisme kan worden geassocieerd met het risico op CL /P.
verklaringen
Dankwoord
Dit onderzoek werd gesteund door het openbaar Welzijn Fonds Project voor Wetenschap van de provincie Liaoning (No: 2012002015). en een subsidie van het Science and Technology Project van Shenyang (Grant nr .: F13-220-9-73)
Authors 'originele ingediende dossiers voor afbeeldingen
Hieronder staan de links naar originele ingediende dossiers van de auteurs voor afbeeldingen. 'Originele bestand voor figuur 1 12903_2014_415_MOESM2_ESM.tif Authors' 12903_2014_415_MOESM1_ESM.tif Auteurs originele bestand voor 'originele bestand voor figuur 3 12903_2014_415_MOESM4_ESM.tif Authors' figuur 2 12903_2014_415_MOESM3_ESM.tif Auteurs originele bestand voor figuur 4 originele bestand 12903_2014_415_MOESM5_ESM.tif Authors 'voor figuur 5 12903_2014_415_MOESM6_ESM.tif Authors 'originele bestand voor figuur 6 concurrerende belangen Ondernemingen de auteurs verklaren dat ze geen concurrerende belangen.
auteurs bijdragen
CF deelgenomen aan de selectie van de studie, het extraheren van de gegevens, het uitvoeren van de statistische analyse en het opstellen van het manuscript. EZ en WD deelnamen aan studie selectie, data-extractie en manuscript opstellen. ZX verzameld en onttrokken gegevens. YZ en LL deelnamen aan studie selectie en de statistische analyse. Alle auteurs gelezen en goedgekeurd het definitieve manuscript.
