Er zijn bepaalde momenten waarop een wortelkanaalbehandeling procedure lijkt te mislukken. Wanneer er iets als dit gebeurt, zal de tandarts schuld meestal proberen om het wortelkanaal opnieuw uit te voeren, zodat het correct is ingevuld. Deze tandarts zal waarschijnlijk gaan over het werk van het proberen om de oude vulmaterialen die zijn gebruikt voor het root (namelijk de endodontische cement dat gebruikt werd om het te verzegelen en de gutta percha) verwijderen. Daarna zal hij proberen de tand verplaatsen alvorens de materialen die werden afgesloten.
Het probleem is echter dat de oude vulling zeer moeilijk te verwijderen van de tand kan worden. Het maakt het nog moeilijker indien in een reeds in het gat in de tand geplaatst om de preparatie voor een kroon wordt geplaatst. Als dit het geval is, een röntgenfoto worden gebruikt om de fout die is gekoppeld aan de wortel te tonen. Er is een chirurgische procedure die kan worden gebruikt om zich te ontdoen van de gewraakte wortel tip genoemd Apexresectie. Deze procedure zal het ook mogelijk de tandarts om zich te ontdoen van elke abces die mogelijk zijn in verband met de mislukte wortelkanaalbehandeling.
De procedure van een Apexresectie wordt ingevuld door het snijden van de zachte weefsel klep die ligt net boven de behandelde tand, waar de punt van het wortelkanaal wordt weergegeven. Deze snit ook daadwerkelijk dwars door het bot en amputeren het puntje van de wortel. De reden voor deze operatie is om te proberen en te ontdoen van de levende of dode weefsel dat is het probleem veroorzaakt. Dit zal meestal genoeg om zich te ontdoen van het probleem, maar soms zal de tandarts een kleine holte voorbereiding op het puntje van de root te maken. Nadat hij dit doet zal de tandarts dan afdichten het kanaal met een kleine amalgaam vulling.
Indien het niet mogelijk om dit kleine vulling doen, dan de tandarts kan ook proberen een retrofill. Een retrofill bestaat uit het smelten van een deel van de guttapercha aan de punt van de root te proberen en maak een afdichting. Deze twee procedures (apicoectomies en retrofills) zijn meestal een laatste wanhopige poging van een tandarts om te proberen en op te slaan de tand die endodontisch behandeld is. Ze worden meestal gebruikt in een mislukte wortelkanaalbehandeling tand die een post ingebracht in de kern. Dit is een manier om een afdichting te creëren en redden van de tand.