Abstracte achtergrond
Streptococcus mutans
(S. mutans
) is de primaire etiologische agent van cariës. Sortase is een transpeptidase dat verschillende oppervlakte-eiwitten koppelt aan de S. mutans
celwand en is aangetoond dat het een belangrijke rol speelt in cariogeniciteit. Het doel van deze studie was om de genetische polymorfismen van de sortase gen (srtA
) en de sociaal-gedragsmatige factoren die samenhangen met cariës bij kinderen met S. mutans
verkennen.
Methods
In deze case-control studie werden 121 S. mutans
stammen separaat geselecteerd uit cariës-vrij kinderen en zeer ernstige cariës kinderen voor het rangschikken van de srtA
gen. Maatschappij- en gedragswetenschappen gegevens werden verzameld door zelf in te vullen vragenlijsten. Genomisch DNA werd geëxtraheerd uit S. mutans stammen
en geamplificeerd door PCR om de srtA
gen te verkrijgen. De gezuiverde PCR-producten werden gesequenced en geanalyseerd op mutaties met ABI Variant Reporter software. De verdeling van missense mutaties en het gemiddelde van sociale gedrags- factoren werden vergeleken tussen de groepen. Een meervoudig logistisch regressiemodel werd gebruikt voor het regelen van verstorende factoren.
Resultaten
De mutatie frequenties loci 168 (P
= 0,023) en 470 (P
= 0,032) significant verschillend tussen de groepen . De best passende model bleek dat veel ouder, hoge frequenties vaste suikerconsumptie langdurige borstvoeding, een groot deel van zichtbare plaque en S. mutans hotels met een T op locus 168 van de srtA
gen geassocieerd met zeer ernstige cariës bij kinderen (P Restaurant & lt; 0,05). Kinderen met een G op locus 168 van S. mutans
had een verminderd risico op zeer ernstige cariës (OR = 0,32, 95% CI = 0,12-0,86) in vergelijking met degenen die een T.
Conclusies
de huidige studie gesuggereerd dat de locus 168 missense mutatie van het srtA
gen kan correleren met cariës gevoeligheid bij kinderen met S. mutans
. Bovendien, leeftijd, duur van de borstvoeding, solide consumptie suiker, en slechte mondhygiëne hebben bijgedragen aan deze complexe ziekte.
Sleutelwoorden
cariës Gene polymorfismen srtA
Streptococcus mutans
Li Xia Yu en Ye Tao droegen evenzeer dit werk. achtergrond
cariës is de gelokaliseerde vernietiging van tandheelkundige harde weefsels door zure bijproducten van bacteriële fermentatie van koolhydraten in de voeding [1]. Orale microorganismen, voedingsgewoonten en waardplantgevoeligheid samenwerken in de initiatie en ontwikkeling van cariës [2]. In het algemeen, socio-demografische variabelen, de ontwikkeling kenmerken, algemene opvoeding, mondgezondheid gedrag, mondhygiëne en bacteriën zijn bekende risicofactoren voor het ontwikkelen van cariës bij kinderen [3]. Het is een veel voorkomende ziekte die wereldwijd de gezondheid van kinderen en het welzijn [2,4,5], vooral in China. De Derde Nationale Oral Health Survey in China bleek dat de prevalentie van de kindertijd cariës in het 5-jarige leeftijd was zo hoog als 66% en dat het gemiddelde aantal vervallen, ontbrekende en gevulde tanden (DMFT) bedroeg 3,5 [6] .
Streptococcus mutans
(S. mutans
) is de belangrijkste etiologische agent van cariës [7]. Hoewel het verband tussen S. mutans Kopen en cariës lijkt overtuigend,
sommige kinderen met S. mutans niet manifesteert de ziekte suggereert dat S. mutans
kan variëren in zijn vermogen om cariës te initiëren. Een belangrijk kenmerk van S. mutans
bij de ontwikkeling van cariës is de mogelijkheid om zich aan het tandoppervlak. Pac is een van de celwand verankerd oppervlak geïdentificeerde eiwitten in S. mutans
en is verantwoordelijk voor het mediëren van de hechting van S. mutans Belgique Om tandoppervlakken [8]. Sortase A (srtA), gecodeerd door het gen srtA
, is aangetoond dat een gelokaliseerde transpeptidase dat covalent eiwit Pac met een sorteer signaal aan de celwand en bezit belangrijke hechtende functies die zijn geassocieerd met cariogeniciteit zijn [ ,,,0],9,10]. S. mutans hotels met een gemuteerd
srtA gen te leiden tot een duidelijke vermindering van de hechting potentieel van S. mutans Kopen en de frequentie van tandcariës [11]. Omdat een belangrijke functie van srtA
is de hechting van S. mutans
het tandoppervlak veronderstelden we dat de srtA
gen van S. mutans zou
genetische polymorfismen gevolg van verschillende omstandigheden cariës bezitten.
Gezien de complexe etiologie van cariës, de virulentie en kolonisatie van S. mutans
kan gemoduleerd worden door gedrags-, sociale en omgevingsfactoren [12,13]. In deze studie hebben we gericht op de genetische polymorfismen van de srtA
gen en het sociaal-gedragsmatige factoren die samenhangen met cariës bij kinderen met S. mutans
verkennen.
Methoden
Berekening van de studie steekproefomvang Hotels A case-control group ontwerp werd toegepast in deze studie. Volgens de onderzoeksopzet, de formules voor het berekenen sequencing monster capaciteit wordt hieronder getoond [14]
Formule 1:. \\ (N = \\ frac {N ^ {\\ hbox { '}}} {4} {\\ links (1+ \\ sqrt {1 + \\ frac {4} {N ^ {\\ hbox { '}} \\ delta}} \\ right)} ^ 2 \\)
Formule 2: \\ ( {N}^{\\hbox{'}}=\\frac{{\\left[{Z}_{\\alpha}\\sqrt{\\left(1+1/C\
ight){\\pi}_c\\left(1-{\\pi}_c\
ight)}+{Z}_{\\beta}\\sqrt{\\pi_2\\left(1-{\\pi}_2\
ight)+{\\pi}_1\\left(1-{\\pi}_1\
ight)/C}\
ight]}^2}{{\\left({\\pi}_2-{\\pi}_1\
ight)}^2} \\)
Formule 3: \\ ({\\ pi} _c = \\ frac {\\ pi_2 + {\\ pi} _1} {2} \\)
Formule 4: δ
= | π
1 - π
2 |
het aantal kinderen dat werd gelijk in het geval en de controle groepen. Dus de waarde van C
was 1,0. De waarde van α werd ingesteld op 0,05 en de waarde van β werd vastgesteld op 0,15. De waarden van π
1 en π
2 om de voorspelde missense mutatie van srtA
in de controle en case groepen in de huidige studie genoemd, respectievelijk. Op basis van de tarieven van elke missense mutatie locus in de cariës-vrij en cariës-actieve groepen van onze eerdere werk [15], de grootste steekproefomvang was vereist wanneer π
1 = 0,6 en π
< sub> 2 = 0,4, respectievelijk. Daarom werd berekend dat de steekproefomvang moeten zijn 121 kinderen per groep. Alle statistische toetsen waren tweezijdig.
Omdat dit onderzoek in de eerste plaats gericht op verbindingen tussen missense mutaties van srtA
en de ernst van cariës in de kinderen te verkennen met S. mutans
, alleen de kinderen die S. uitgevoerd mutans
werden geanalyseerd. Om de vereiste steekproefomvang te voldoen, berekenden we het aantal kinderen die nodig was voor het epidemiologisch onderzoek. De prevalentie van cariës (68%) en niet-cariës (32%) bij jonge kinderen [16], samen met de prevalentie van S. mutans in de
cariësvrije groep (37,5%) en de caries- actieve groep (75%), werden beschouwd [17]. Het minimum aantal kinderen dat vereist is om te onderzoeken werd daarom berekend op 1.009.
Field onderzoek
Een epidemiologisch onderzoek werd uitgevoerd in het district Huadu van Guangzhou in Zuid-China in Oktober 2012 worden uitgevoerd tot en met juni 2013. De studie protocol werd goedgekeurd door de ethische commissie van de Guanghua School of Stomatologie, Sun Yat-sen University (ERC- [2012] -13). De Huadu District is een nieuwe stedelijke wijk die bestaat uit vier straten en zes steden. Er waren 114 kleuterscholen in deze wijk. Een willekeurige steekproef cluster techniek werd gebruikt om 19 scholen selecteren op basis van het aantal kinderen dat we nodig hadden om te werven. Alleen die kinderen die de leeftijd van 36-47 maanden oud, had in het district voor meer dan zes maanden gewoond, meldde geen systematische ziekte, en gemeld geen antibiotica inname voor ten minste de voorgaande maand werden opgenomen in de studie. Alle deelnemende scholen werden in kennis gesteld van en ingestemd met de studie. Na schriftelijke toestemming van de ouders werd verkregen, alle in aanmerking komende 3-jarige kinderen in de deelnemende scholen werden in de studie opgenomen.
Cariës ontwikkeling, email hypoplasie en zichtbare plaque accumulatie werden bepaald door een enkele tandarts (L.X. Yu). CPI probes, wegwerp mond spiegels en intra-orale LED-lichtbronnen werden gebruikt voor de examens. De status van de tandcariës werd opgenomen volgens de World Health Organization criteria met behulp van DMFT indexen [18]. Kortom, de aanwezigheid van cariës werd geregistreerd wanneer er een duidelijke laesie in een put of spleet of glad oppervlak van een tand. Een detecteerbare verzacht wand of ondermijnd email werd ook geregistreerd als cariës. Glazuur hypoplasie werd opgenomen met behulp van de criteria die worden aanbevolen door de Fédération Internationale Dentaire (FDI) voor algemene epidemiologisch onderzoek [19]. Glazuur hypoplasie omvatte drie soorten defecten: kuilen, groeven of ontbrekende glazuur. Mondhygiëne werd beoordeeld met behulp van de Visible Plaque Index (VPI) [20]. Vier locaties van de distale, midmost en mesiale van buccale oppervlakken en de midmost van de linguale oppervlak van elke tand werden onderzocht om de VPI op te nemen. Het percentage van de onderzochte plaatsen met zichtbare plaque berekend. Ongeveer 10% van de proefpersonen werden opnieuw onderzocht om de intra-onderzoeker betrouwbaarheid te beoordelen. Samengevoegde monsters van tandplaque van elk kind werden verzameld met steriele wattenstaafjes uit de buccale oppervlakken van de bovenkaak tanden. De monsters werden gedispergeerd in een steriele vloeistof thioglycolaat (FT) medium en binnen 4 uur van verzameling naar het laboratorium gebracht op ijs.
Gegevens werden verzameld met een zelf-vragenlijst die werd toegediend aan de verzorgers. De vragenlijst bestond uit vier onderdelen: socio-demografische kenmerken (zoals leeftijd en geslacht van de kinderen, beroep en opleidingsniveau van de ouders), ontwikkelingsstoornissen kenmerken (bv, zwangerschapsduur, wijze van levering, het gewicht bij de geboorte en email hypoplasie), algemene opvoeding geschiedenis (bijvoorbeeld flesvoeding ervaring en de duur van de borstvoeding) en mondgezondheid gedrag (bv, solide consumptie suiker, de frequentie van tandenpoetsen en het gebruik van tandpasta).
Isolatie van S. mutans
Plaque monsters werden gemengd en gesoniceerd gedurende 30 seconden en werden gedispergeerd met een verdunningsreeks tot 10 -3 verdunningen te maken. Voor elk monster werd 50 ul van het verdunningsmiddel uitgeplaat op Mitis-Salivarius bacitracine (MSB) agar, gesupplementeerd met 20% sucrose en 0,2 eenheden /ml bacitracine en anaëroob geïncubeerd (85% N 2, 5% CO 2, en 10% H 2) bij 37 ° C gedurende 3 d [21]. We twee willekeurig gekozen kolonies van elk kind volgens de kolonie morfologie en de koloniën getest op hun vermogen om mannitol, sorbitol, raffinose, melibiose en aesculin gisten en hun vermogen om arginine [22] te hydrolyseren. De geïdentificeerde bacteriële stammen werden vervolgens uitgestreken op agar MSB en bewaard in 50% glycerol bij -80 ° C voor gebruik.
Definiëren de behuizing en controlegroepen
verkennen en vergelijk de genetische polymorfismen in het srtA gen
van S. mutans
werden kinderen met verschillende cariës ervaringen in aanmerking genomen. Een totaal van 121 cariës-vrij kinderen met S. mutans
werden willekeurig geselecteerd als de cariës-vrij groep, en 121 kinderen met DMFT ≥6 die waren S. mutans-
positief werden geselecteerd om de zeer ernstige vormen cariës groep. De DMFT score van de zeer ernstige groep was in overeenstemming met de categorie die in een eerdere studie [23].
Extractie van chromosomaal DNA
S. mutans
stammen werden gekweekt in 2 ml van de hersenen-hart infusie bouillon en geïncubeerd bij 37 ° C onder anaërobe omstandigheden gedurende 18 uur. Cellen gecentrifugeerd uit de BHI kweken werden gesuspendeerd in 5% Chelex100, behandeld met 10 ui 20 mg /ml proteinase K bij 37 ° C gedurende 1 min, en vervolgens gedigereerd bij 56 ° C gedurende 1 uur, gevolgd door koken gedurende 10 minuten. De buizen werden bevroren op ijs gedurende 3 minuten, en de suspensie werd gecentrifugeerd bij 12.000 rpm gedurende 10 min. Het supernatant werd verkregen voor PCR. De kwaliteit en kwantiteit van DNA-monsters werden gemeten met een UV-spectrofotometer bij 260 nm en 280 nm. Alle DNA werd opgeslagen bij -20 ° C voor verdere analyse.
Amplificatie en sequencing van het srtA gen
De PCR-primers gemaakt door ABI Primer Designer V3.0 die werden gebruikt om de UA159 srtA
gen staan in tabel 1. Een 1035 bp DNA-fragment dat het srtA
gen werd geamplificeerd uit S. mutans
stammen. Als gevolg van de beperking van de duur van de sequencing leest, we versterkt en de sequentie van het gen in drie fragmenten die overlappende sections.Table 1 PCR-primers gebruikt voor de detectie van de srtA gen in S. mutans
Primer
bevatte sequentie (5'-3 ')
grootte van het product (bp)
Pair1-F
GACGTTTGGCAACTGGTGTG
557
Pair1-R
CCAAGCAATTAGGGCATTTC
Pair2-F
CAATGAAAAAAGAACGTCAATCTA
448
Pair2-R
TGTGAAGATCCGGTCATACCA
Pair3-F
CGGAATTGCCATTCCAGACT
721
Pair3-R
TCCGAAACTATCAAAGCAACAT
De PCR-reactie werd uitgevoerd in een 25 ul reactie volume uitgevoerd. De componenten in de PCR-reactie (eindconc.) Waren 2,5 pi 10 x PCR-buffer, 0,2 mM dNTP mengsel, 1,5 mM MgCl 2, 0,2 pM van elke primer, 100-400 ng genomisch DNA als matrijs, en 2U Platinum® Taq DNA Polymerase (Invitrogen, CA, USA). Gematigde werd voorverwarmd bij 95 ° C 5 min. De PCR-cyclus was als volgt: denaturatie bij 95 ° C gedurende 30 seconden, hybridisatie bij 60 ° C gedurende 30 s en verlenging bij 72 ° C gedurende 50 s. Een totaal van 50 cycli werden uitgevoerd, gevolgd door een laatste verlenging bij 72 ° C gedurende 5 minuten. Vijf microliter van elk geamplificeerde producten werd geanalyseerd door elektroforese op een 1,5% agarosegel. De PCR producten werden gezuiverd met een QIAquick Gel Extraction Kit (Qiagen, Hilden, Duitsland). Uiteindelijk werden de producten gesequenced door de Shanghai Life Technologies biotechnologiebedrijf (Life Technologies, Shanghai, China). Variant Reporter software werd gebruikt om de sequencing resultaten te analyseren, en de srtA
sequentie van S. mutans
UA159 werd geselecteerd als een referentie reeks.
Statistische analyse
Data-analyse met behulp van de SPSS 16.0 werd uitgevoerd software. Categorische en continue variabelen werden vergeleken met behulp van een Chi-kwadraat test en een onafhankelijke samples t
test, respectievelijk. Bivariate en multivariate analyses werden gebruikt om odds ratio (OR's) te berekenen met de bijbehorende 95% betrouwbaarheidsintervallen (CI) en identificeren van de factoren die samenhangen met zeer ernstige cariës. Cariës status werd behandeld als de afhankelijke variabele (0 = cariës vrij groep, 1 = zeer ernstige cariës groep). Onafhankelijke variabelen waren die factoren die cariës status van invloed kunnen zijn geweest. Die onafhankelijke variabelen met P Restaurant & lt; 0,2, gebaseerd op een bivariate logistische analyse werden verder getest in een meervoudig logistisch regressiemodel. AP
waarde. & Lt; 0,05 voor alle tweezijdige statistische tests werd significant beschouwd
Resultaten
De statistische analyse van de sociaal-economische demografische kenmerken en ontwikkelingsstoornissen factoren zijn weergegeven in tabel 2. In de sociale indicatoren, we aanzienlijk gevonden verschillende distributies in de leeftijd (in maanden) tussen de groepen (P Restaurant & lt; 0,001). Onder de variabelen die kinderen mondgezondheid gedrag (tabel 3), de duur van de borstvoeding (P
= 0,09), de frequentie van vaste suikerconsumptie (P Restaurant & lt; 0,01) en het aandeel van de VPI (P
& lt; 0,01) werden alle significant geassocieerd met cariës risk.Table 2 Bivariate analyse van demografische, socio-economische ontwikkeling en de kenmerken met betrekking tot de status van cariës
Variabelen
Controls (n = 121)
Cases (n = 121)
x 2
P-waarde *
COR (95% CI)
P-waarde
n (%)
n (%)
Part1 demografische en sociaal-economische kenmerken
Sex
1.345
0,246
Mannetjes †
59
(48,8)
69
(57,0)
Vrouwtjes
62
(51,2)
52
(43,0)
0,72 (0,43-1,19)
0,198
Moederdag scholing
1.369
0,242
≥12 jaar †
74
(61,2)
65
(53,7)
& lt; 12 jaar
47
(38,8)
56
(46,3)
0,74 (0,44-1,23)
0,242
scholing Father's
3,615
0,057
≥12 jaar †
87
(71,9)
73
(60,3)
& lt; 12 jaar
34
(28,1)
48
(39,7)
0,59 (0,35-1,02 )
0,058
bezetting Moederdag
1,813
0,404
0,413
Employer/Professional †
8
(6.6)
14
(11,6)
Employee/Non-professionele
88
(72,7)
84
(69,4)
0.55(0.22-1.37)
0.196
Unemployed
25
(20.7)
23
(19.0)
0,53 (0,19-1,48)
0.224
bezetting
Vader
3,503
0,173
0,181
Employer/Professional †
22
(18.2)
29
(24,0)
Employee/Non-professionele
92
(76,0)
90
(74,4)
0.74(0.40-1.39)
0.350
Unemployed
7
(5.8)
2
(1.7)
0,22 (0,04-1,15)
0,072
Mean (SD)
Mean (SD)
t Electronics Test
Leeftijd (maanden)
41.6
(2.9)
43.4
(3.6)
−4.285
<0.001**
1.18(1.09-1.28)
<0.001
de leeftijd van de moeder bij de geboorte van het kind
27.1
(3.8)
26.4
(3.8)
1.517
0.131**
0.95(0.89-1.02)
0.132
Deel 2 Ontwikkeling kenmerken
Zwangerschapsduur
0,066
0,797
≥37 weken †
58
(47,9)
60
(49,6)
& lt; 37 weken
63
(52.1 )
61
(50,4)
0,94 (0,57-1,55)
0,797
wijze van levering
0,281
0,596
vaginale geboorte †
73
(60,3)
77
(63,6)
keizersnede geboorte
48
(39,7)
44
(36,4)
0,87 (0,52 -1,46)
0,596
gewicht bij de geboorte
2,381
0,123
≥2500 g †
118
(97,5)
113
(93,4)
& lt; 2500 g
3
(2.5)
8
(6.6)
2,79 (0,72-10,76)
0,138
Enamel hypoplasie
-
-
verhuur No †
121
(100.0 )
120
(99,2)
Ja
0
(0,0)
1
(0,8)
-
-
* Chi-kwadraat test, ** Independent samples t Electronics test.
COR (ruwe odds ratio), CI (betrouwbaarheidsinterval), † Referentie categorie.
Tabel 3 Bivariate analyse van de algemene opvoeding en mondgezondheid gedrag met betrekking tot de status van cariës
Variabelen
Controls (n = 121)
Cases (n = 121)
x 2
P-waarde *
COR (95% CI)
P-waarde
n (%)
n (%)
deel 1 Algemeen opvoeding tussen 0-3 jaar
flesvoeding ervaring
0,764
0.382
Ja †
22
(18.2)
17
(14.0 )
Geen
99
(81,8)
104
(86,0)
1,36 (0,68-2,71)
0,383
Duur van de borstvoeding
9,382
0.009
0,012
nooit borstvoeding †
22
(18.2)
9
(7,4)
& lt; 1 bouwjaar
84
(69,4)
84
(69,4)
2,44 (1,06-5,62)
0,035
≥1 jaar
15
(12,4)
28
(23.1)
4,56 (1,68-12,37)
0,003
Part 2 Mondgezondheid gedrag op de leeftijd van 3
Solid suikerconsumptie
19,492
& lt; 0,001
Restaurant & lt; 1 keer per dag †
86
(71,1)
52
(43,0)
≥1 keer per dag
35
(28,9)
69
(57,0)
3,26 (1,91-5,56)
& lt; 0,001
Frequentie van tandenpoetsen
0,154
0,695
≥1 keer per dag †
73
(60,3)
70
(57,9)
& lt; 1 keer per dag
48
(39,7 )
51
(42,1)
1,11 (0,66-1,85)
0,695
Het gebruik van tandpasta
0.000
1,000
1,000
Always †
70
(57,9)
70
(57,9)
Soms
29
(24,0)
29
(24,0)
1.00(0.54-1.84)
1.000
Never
22
(18.2)
22
(18.2)
1,00 (0,51-1,97)
1.000
Mean (SD)
Mean (SD)
t Electronics Test
Visible plaque index (%)
46.2
(20.9)
75.7
(15.8)
−12.386
<0.001**
1.08(1.06-1.10)
<0.001
* Chi-kwadraat test, ** Independent samples t Electronics Test.
COR (ruwe odds ratio), CI (betrouwbaarheidsinterval), † Referentie categorie.
Bij het vergelijken van de srtA
sequenties van de klinische stammen met S. mutans
UA159, in totaal 38 single nucleotide substituties werden gevonden, waaronder 21 stille mutatie sites en 17 missense mutatie plaatsen (figuur 1). De cariës-vrij groep bleek 19 stille mutatie sites en 11 missense mutatie sites hebben, terwijl de groep, zeer ernstige cariës bleek 20 stille mutatie sites en 14 missense mutatie sites. Slechts tien stammen waren identiek aan stam UA159; van deze vijf waren afkomstig uit de cariës-vrij groep, en vijf waren afkomstig uit de zeer ernstige cariës groep. Geen van de srtA
genen in de sequenties hadden een base insertie of deletie. Figuur 1 punt mutaties in klinische isolaten. Gedetailleerde legende: The No. 306 klinische isolaat (cariës-vrij groep) heeft wijzen mutaties op 78, 99, 112, 114, 165, 168, 176, 222, 249, 312, en 671 locus bases. De nummer 139 klinische isolaat (zeer ernstige cariës groep) had een punt mutatie op 78, 150, 165, 168, 176, 671 locus bases.
Silent mutatie sites in de klinische stammen werden geïdentificeerd op de posities 48, 78, 85, 99, 138, 150, 162, 165, 183, 186, 222, 237, 249, 261, 312, 357, 582, 615, 636, 669 en 717.
Missense mutatieplaatsen in de klinische stammen waren die op posities 23, 34, 36, 47, 100, 112, 114, 168, 176, 256, 298, 382, 470, 548, 584, 671 en 706. Het aminozuur transversies door missense mutaties worden in tabel 4. Hier hebben we de veranderingen van aminozuren als gevolg van missense mutaties tonen alleen omdat deze veranderingen kunnen invloed hebben op de activiteit van sortase A.Table 4 transversie van aminozuren als gevolg van missense mutaties volgens codons
Base website
UA159
Clinal stammen
Codon
aminozuur
Codon
aminozuur
23
AGG
Arginine
AAG
Lysine
34
AGT
Serine
GGC/GGT
Glycine
36
AGT
Serine
GGC/GGT
Glycine
47
ACC
Threonine
ATC
Isoleucine
100
CCA
Proline
TCA
Serine
112
GCC
Alanine
ACC/ACT
Threonine
114
GCC
Alanine
ACT
Threonine
168
GAT
Asparaginic acid
GAG
Glutaminezuur acid
176
CAC
Histidine
CGC
Arginine
256
GCT
Alanine
TCT
Serine
298
GAC
Asparaginic acid
AAC
Asparagine
382
GTC
Valine
ATC
Isoleucine
470
CGT
Arginine
CAT
Histidine
548
GTC
Valine
GCC
Alanine
584
CCG
Proline
CTG
Leucine
671
AAT
Asparagine
ACT
Threonine
706
GCT
Alanine
ACT
Threonine
De uitkeringsfrequenties van de missense-mutatie sites staan in Tabel 5. Er werd een significant verschil in de mutatiefrequentie bij locus 168 (P
= 0,023); de frequentie van mutaties op deze plaats was in de cariësvrije groep significant hoger dan in de zeer ernstige cariës groep. Bovendien stammen met de locus 470 polymorfisme vertoonden een significant hoger percentage in de groep, zeer ernstige cariës vergeleken met de cariës-vrij groep (P
= 0,032) .table 5 Bivariate analyse van de missense mutatie in relatie tot de status van cariës
Missense mutatie
Controls (n = 121)
Cases (n = 121)
x 2
P-waarde *
COR (95% CI)
P-waarde
n (%)
n (%)
23 G → A †
5
(4.1)
12
(9.9)
3.100
0.078
2.55(0.87-7.49)
0.087
34 A → G
7
(5.8)
10
(8.3)
0.569
0.450
0.68(0.25-1.85)
0.453
36 T → C
6
(5.0)
11
(9.1)
1.582
0.209
1.92(0.69-5.36)
0.215
47 C → T
8
(6.6)
11
(9.1)
0.514
0.473
1.41(0.55-3.64)
0.475
100 C → T
0
(0.0)
1
(0.8)
—
1.000**
—
1.000
112 G → A
71
(58.7)
71
(58.7)
0.000
1.000
1.00(0.60-1.67)
1.000
114 C → T
65
(53.7)
56
(46.3)
1.339
0.247
0.74(0.45-1.23)
0.248
168 T → G
26
(21.5)
13
(10.7)
5.166
0.023
0.44(0.21-0.90)
0.025
176 A → G
63
(52.1)
68
(56.2)
0.416
0.519
1.18(0.71-1.96)
0.519
256 G → T
1
(0.8)
0
(0.0)
—
1.000**
—
1.000
298 G → A
1
(0.8)
0
(0.0)
—
1.000**
—
1.000
382 G → A
1
(0.8)
0
(0.0)
—
1.000**
—
1.000
470 G → A
7
(5.8)
17
(14.0)
4.625
0.032
2.66(1.06-6.68)
0.037
548 T → C
0
(0.0)
1
(0.8)
—
1.000**
—
1.000
584 C → T
0
(0.0)
1
(0.8)
—
1.000**
—
1.000
671 A → C
115
(95.0)
116
(95.9)
0.095
0.758
0.83(0.25-2.78)
0.758
706 G → A
0
(0.0)
1
(0.8)
—
1.000**
—
1.000
* Chi-kwadraat test. ** Fisher's exact test.
† G → A, G staat voor de 23 locus base in UA159, A de 23 locus base in de klinische stammen.
COR (ruwe odds ratio), CI (betrouwbaarheidsinterval). Belgique Om te controleren voor verstorende factoren, werden multiple logistische regressie analyses uitgevoerd en de resultaten (tabel 6) toonde aan dat een grotere leeftijd (P
= 0,027), hoge frequenties van vaste suikerconsumptie (P Restaurant & lt; 0,001 ), langdurige borstvoeding (P
= 0,028), een groot deel van de zichtbare plaque (P Restaurant & lt; 0,001) en S. mutans
stammen met een T op locus 168 van de srtA
gen (P
= 0,023) werden significant geassocieerd met zeer ernstige cariës bij kinderen. Een lager risico op zeer ernstige cariës (AOR = 0,32, 95% CI = 0,12-0,86) werd gevonden bij kinderen die S. mutans
stammen met een G op locus 168 van de srtA
gen in vergelijking met uitgevoerd een T. echter, na correctie voor verstorende factoren, de mutatie op locus 470 werd uitgesloten van de model.Table 6 Samenvatting van de multiple logistische regressie resultaten
Variabelen
B ‡
SE
P
AOR
95% CI voor AOR
Neder
Upper
Mutaties op locus 168
verhuur No †
Yes
−1.156
0.510
0.023
0.32
0.12
0.86
Duration van borstvoeding
0,028
nooit borstvoeding †
& lt; 1 jaar
1.273
0,651
0.050
3,57
1.00
12.79
≥1 jaar
2,058
0,772
0.008
7,83
1,73
35,54
Solid suikerconsumptie
< (months)
0.131
0.059
0.027
1.14
1.02
1.28
Visible (%)
0.090
0.012
<0.001
1.09
1.07
1.12
Constant
−16.110
3.263
<0.001
0.00
